Chumley retorna à Academia de Duelos, acompanhado de seu chefe — ninguém menos que Maximillion Pegasus, o criador das cartas de Duel Monsters. Porém, a visita tem um motivo sério: o projetista-chefe da Industrial Illusions, Frantz, roubou a Carta dos Deuses – O Dragão Alado de Rá e está usando seu poder indevidamente durante o Torneio GX. Antes do confronto, Chumley entrega a Jaden uma nova carta criada por ele — um presente especial para ajudá-lo a vencer duelos difíceis. Determinado a recuperar Rá, Jaden desafia Frantz para um duelo. Frantz, tomado pela inveja do sucesso de Chumley, revela que sempre se sentiu esquecido e desvalorizado, acreditando que ninguém reconhecia seu talento. Usando uma carta mágica poderosa, ele aprisiona o Dragão Alado de Rá em correntes místicas, controlando seu poder artificialmente. Mesmo diante do poder divino de Rá, Jaden mantém a calma e ativa sua nova carta de campo — Arranha-Céu 2: Cidade dos Heróis (Skyscraper 2 – Hero City).